Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Carmil2Q3V3V9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Carmil2Q3V3V9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Carmil2Q3V3V9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Carmil2Q3V3V9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Carmil2Q3V3V9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Carmil2Q3V3V9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms