Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pydc3Q3V3Q4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pydc3Q3V3Q4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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