Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ccdc185Q3V118 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ccdc185Q3V118 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc185Q3V118 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ccdc185Q3V118 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc185Q3V118 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc185Q3V118 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ccdc185Q3V118 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Ccdc185Q3V118 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Ccdc185Q3V118 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Ccdc185Q3V118 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc185Q3V118 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc185Q3V118 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc185Q3V118 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc185Q3V118 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc185Q3V118 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ccdc185Q3V118 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc185Q3V118 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc185Q3V118 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ccdc185Q3V118 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms