Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms