Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clpsl2Q3UW21 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clpsl2Q3UW21 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms