Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trat1Q3UU67 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trat1Q3UU67 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms