Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syndig1lQ3USQ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syndig1lQ3USQ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms