Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nhlrc4Q3UP44 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms