Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Tmem253Q3UNB8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Tmem253Q3UNB8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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