Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl2Q3UMU9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl2Q3UMU9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl2Q3UMU9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl2Q3UMU9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms