Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mccc2Q3ULD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mccc2Q3ULD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms