Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E330014E10RikQ3UL33 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms