Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Edc4Q3UJB9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edc4Q3UJB9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Edc4Q3UJB9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Edc4Q3UJB9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms