Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dtx3lQ3UIR3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms