Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arfgef3Q3UGY8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arfgef3Q3UGY8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms