Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Zyg11bQ3UFS0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zyg11bQ3UFS0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms