Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam35aQ3UEN2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam35aQ3UEN2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam35aQ3UEN2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam35aQ3UEN2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms