Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LbrQ3U9G9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms