Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VwceQ3U515 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VwceQ3U515 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VwceQ3U515 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VwceQ3U515 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms