Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hvcn1Q3U2S8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hvcn1Q3U2S8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hvcn1Q3U2S8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hvcn1Q3U2S8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hvcn1Q3U2S8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hvcn1Q3U2S8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hvcn1Q3U2S8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms