Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud5Q3U2S4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms