Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palb2Q3U0P1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Palb2Q3U0P1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms