Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hace1Q3U0D9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Hace1Q3U0D9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hace1Q3U0D9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms