Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21440Q3TTD8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms