Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnpla6Q3TRM4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla6Q3TRM4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms