Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
XylbQ3TNA1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XylbQ3TNA1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XylbQ3TNA1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms