Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Smarca4Q3TKT4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca4Q3TKT4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms