Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdlim7Q3TJD7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdlim7Q3TJD7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms