Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc13Q3TIR1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms