Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2f1Q3THK3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf2f1Q3THK3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f1Q3THK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms