Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem248Q3TBN1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem248Q3TBN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem248Q3TBN1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem248Q3TBN1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem248Q3TBN1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem248Q3TBN1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem248Q3TBN1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms