Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms