Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr27Q3SYJ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr27Q3SYJ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms