Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbtb38Q3LR78 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zbtb38Q3LR78 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zbtb38Q3LR78 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms