Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M3Q31093 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms