Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psd3Q2PFD7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psd3Q2PFD7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psd3Q2PFD7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psd3Q2PFD7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psd3Q2PFD7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms