Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam178bQ24JP3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam178bQ24JP3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam178bQ24JP3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam178bQ24JP3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam178bQ24JP3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam178bQ24JP3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam178bQ24JP3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam178bQ24JP3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam178bQ24JP3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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