Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpne9Q1RLL3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne9Q1RLL3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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