Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim71Q1PSW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim71Q1PSW8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms