Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo3bQ1EG27 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo3bQ1EG27 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo3bQ1EG27 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo3bQ1EG27 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo3bQ1EG27 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo3bQ1EG27 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo3bQ1EG27 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms