Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam171bQ14CH0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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