Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lingo4Q149C3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lingo4Q149C3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Lingo4Q149C3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms