Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf3ip1Q149C2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf3ip1Q149C2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Traf3ip1Q149C2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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