Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Vps8Q0P5W1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Vps8Q0P5W1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms