Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SobpQ0P5V2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SobpQ0P5V2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SobpQ0P5V2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SobpQ0P5V2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms