Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r181Q0P547 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms