Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ttc21bQ0HA38 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms