Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
1700061G19RikQ08EE8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms