Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssrp1Q08943 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssrp1Q08943 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms