Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SctQ08535 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SctQ08535 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SctQ08535 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SctQ08535 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SctQ08535 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SctQ08535 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SctQ08535 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SctQ08535 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SctQ08535 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SctQ08535 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SctQ08535 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SctQ08535 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SctQ08535 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SctQ08535 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SctQ08535 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SctQ08535 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SctQ08535 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SctQ08535 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SctQ08535 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SctQ08535 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SctQ08535 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SctQ08535 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SctQ08535 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms